Proton Pass가 중첩 폴더와 폴더 내 검색, URL별 자동완성 조건, 유출 비밀번호 알림을 순차 배포한다. 자동완성은 호스트 일치와 금지 규칙 및 고급 패턴으로 조절할 수 있고 유출 검사는 기기 안에서 비밀번호 지문을 알려진 목록과 비교한다. 공식 설명에 따르면 무료 및 Essentials 사용자는 폴더를 만들 수 없지만 유료 사용자가 공유한 보관함의 폴더는 이용할 수 있다. 개별 폴더 공유는 계획 단계이며 현재는 보관함의 공유 설정을 따른다.